Для чого використовується ChIP PCR?

Аналізи ChIP-PCR і ChIP-qPCR найкраще підходять для аналізу одного гена та можуть бути використані для ампліфікації та кількісного визначення специфічних фрагментів ДНК швидким і економічно ефективним способом.

Кількісна ПЛР у реальному часі (qPCR) дозволяє кількісно визначити концентрацію ДНК у кількох зразках у режимі реального часу, аналізуючи інтенсивність флуоресцентного сигналу, пропорційну кількості амплікону після завершення аналізу імунопреципітації хроматину (ChIP) і очищення зразка.

ChIP також прагне визначити конкретне місце в геномі, з яким пов'язані різні модифікації гістонів, вказуючи мішень модифікаторів гістонів. ChIP має вирішальне значення для прогресу в галузі епігеноміки та вивчення епігенетичних явищ.

Завдяки поєднанню аналізів імунопреципітації хроматину (ChIP) із секвенуванням, секвенування ChIP (ChIP-Seq) є потужним методом для визначення сайтів зв’язування транскрипційних факторів та інших білків у геномі ДНК. Відповідно до протоколів ChIP, зв’язаний з ДНК білок імунопреципітується за допомогою специфічного антитіла.

In silico PCR відноситься до використовуваних обчислювальних інструментів для розрахунку теоретичних результатів полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) з використанням заданого набору праймерів (зондів) для ампліфікації послідовностей ДНК із секвенованого геному або транскриптома. Ці інструменти використовуються для оптимізації дизайну праймерів для послідовностей цільової ДНК або кДНК.

Аналізи ChIP-PCR і ChIP-qPCR найкраще підходять для аналізу одного гена, і їх можна використовувати ампліфікувати та кількісно визначити конкретні фрагменти ДНК швидким та економічно ефективним способом.