Які 3 кроки до вивчення метагеноміки?

Відбір проб і обробка Обробка зразків є першим і найважливішим кроком у будь-якому проекті метагеноміки. Екстрагована ДНК має бути репрезентативною для всіх клітин, присутніх у зразку, і необхідно отримати достатню кількість високоякісних нуклеїнових кислот для подальшого створення бібліотеки та секвенування.

Метагеноміка передбачає низку кроків, у тому числі збір зразків, екстракція, підготовка ДНК, секвенування, біоінформатика та звітність. Упередженість на кожному кроці сприяє помилці остаточного аналізу. Завдяки широкому спектру варіантів для кожного кроку два аналізи можуть дати різні результати.

Історично вивчення метагеноміки залучало складні та трудомісткі методики, в т.ч виділення бактеріальних клонів, вирощування їх у культурі, клонування ДНК та секвенування Сенгера цих окремих молекул ДНК (Ескобар-Зепеда та ін.

У метагеноміці генетичні матеріали (ДНК, C) витягуються безпосередньо із зразків, взятих із навколишнього середовища (наприклад, ґрунту, морської води, кишківника людини, A) після фільтрації (B), і секвенуються (E) після розмноження шляхом клонування (D ) у підході, який називається послідовність дробовика.

Які принципи метагеноміки? Метагеноміка заснована на тому принципі спільноти мікробів та їхні гени у зразках мікробіомів можна ідентифікувати шляхом відображення послідовностей ДНК у базах даних відомих особливостей.